تأسست اول مختبرات كلية طب الاسنان مع بدايات تاسيس الكلية في العام 1953 وهي مختبرات صناعة الاسنان ومختبرات معالجة الاسنان وكان هناك مسؤول مختبرات اسمه السيد كرايتن الذي توفي في العراق و دفن في ارضه.
تم انشاء اول مختبر للتقطيع النسيجي في عام 1970 وهو مختبر يعنى بتشخيص حالات امراض سرطان الفم في العراق ومازال المختبر يحتفظ بعينات تعود للسبعينيات والثمانينيات من القرن الماضي ويعتبر هذا المختبر المختبر الاساس لتشخيص امراض سرطان الفم في العراق ومازال مستمر بتقديم الخدمات حيث استقبل المختبر اكبر عدد المرضى سجل للعام 2017-2018.
تم انشاء عدد من المختبرات التعليمية في العام 1990-1991 في فروع العلوم الاساسية والتشخيص الفمي وتقويم الاسنان واستمر رفد الكلية بالمختبرات التعليمية حيث تم افتتاح عدد من المختبرات في عام 2011-2012 والعام 2015-2016 حيث تم انشاء مختبر للتشريح ومختبر للكيمياء الحياتية ومختبر حديث للفانتوم مخصص للدراسات العليا
سعيا من الكلية لتلبية كافة احتياجات الطلبة ورفع المستوى التعليمي .
العدد الحالي لمختبرات كلية طب الاسنان (اثنان وعشرون مختبر ) الغالبية العظمى من مختبرات كلية طب الاسنان ذات طابع تعليمي تقدم خدمات تعليمية للطلبة تتعلق بالمادة العلمية الخاصة بدراسة طب وجراحة الفم والاسنان حيث تعتمد الدراسة العملية للطلبة في المراحل الثلاثة الاولى على المختبرات بينما تنقسم الدراسة العملية في المرحلة الرابعة بين المختبرات والعيادات التعليمية هذا بالاضافة الى مختبرات الدراسات العليا التي تقدم مساعدة لطلبة الدراسات العليا من حيث اجراء البحوث العلمية.
كما وتتمتع بعض المختبرات بطابع تعليمي وعلاجي كمختبر التعويضات الاصطناعية ومختبر التيجان والجسور ومختبر تقويم الاسنان حيث تقدم هذه المختبرات خدمات علاجية من حيث تصنيع اطقم الاسنان الكاملة واطقم الاسنان الجزئية الثابتة والمتحركة واجهزة تقويم الاسنان المتحركة بالاضافة الى الخدمات العلاجية المقدمة من قبل مختبر التقطيع النسيجي من حيث تشخيص امراض سرطان الفم.